（一）真菌熒光染色鏡檢項目。通過特殊的熒光素與真菌細胞壁的幾丁質和纖維素相結合在熒光顯微鏡下發出熒光檢測真菌成分，較傳統真菌檢測具有高特異性、高敏感性的優點，極大降低了傳統真菌直接鏡檢的誤檢、漏檢率，為臨床真菌感染疾病診治提供了更精準的診斷依據。臨床適應癥包括淺表及深部真菌感染，標本類型包括皮屑、甲屑、毛發、膿液，分泌物、痰液，尿液等各種標本。
（二）細菌培養鑒定及藥敏。實驗室現有VITEK2-compact細菌鑒定及藥敏分析儀一臺，可對各類細菌進行鑒定以及藥敏試驗，使用自動化儀器和紙片擴散法等為臨床提供藥敏數據。
（三）病原體分子鑒定項目。在傳統鏡檢及培養項目的基礎上，增設快速、精準的分子檢測技術，有效彌補傳統病原體培養周期長的不足，檢測時間可縮短至數小時。基于PCR的檢測技術可早期、快速、敏感、特異性檢測侵入體內的外源性基因，不僅可以對微生物感染進行準確的病因學診斷，還可對感染性病原體進行基因分型。本科室開展分枝桿菌（麻風分枝桿菌、結核分枝桿菌、非結核分枝桿菌）qPCR檢測、淋球菌DNA檢測、支原體DNA檢測、衣原體DNA檢測、梅毒分泌物/血液DNA檢測和乙肝病毒定量檢測。同時可利用一代測序等技術對罕見病原體進行測序鑒定，實現更精準的病因學診斷。
